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全基因组DNA甲基化测序

全基因组DNA甲基化测序是将重亚硫酸盐处理方法和Illumina HiSeq高通量测序平台相结合,对有参考基因组的物种进行全基因组水平的甲基化研究。WGBS可以达到单碱基分辨率,精确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态,从而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。


— 样本要求

DNA样品总量: ≥6 μg,DNA样品浓度: ≥100 ng/μL


— 分析内容包括:

1、参考序列比对:C位点覆盖度统计、比对率统计、测序深度统计

2、甲基化分析:甲基化水平统计、全基因组甲基化水平统计、染色体水平甲基化密度分布、不同基因组功能元件甲基化分布统计、CpG, CHG, CHH甲基化比例统计

3、差异甲基化区域分析:DMR相关基因功能注释、DMR相关基因富集分析


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